More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2089 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.52 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.91 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  32.83 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  51.92 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  51.92 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.66 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>