More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2015 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 732 aa  1517    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 801 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 776 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 678 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 763 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  24.69 
 
 		 776 aa  161  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 759 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 693 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 692 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 694 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 724 aa  132  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 742 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 677 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 699 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 780 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 677 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 719 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 733 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 702 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 702 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 698 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 698 aa  114  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 698 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.79 
 
 		 685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  24.48 
 
 		 744 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 734 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 685 aa  107  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 725 aa  107  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  25.45 
 
 		 709 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 689 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 694 aa  103  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 681 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 682 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 689 aa  101  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 713 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 680 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 727 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 682 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 685 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 709 aa  97.8  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 818 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  24.05 
 
 		 687 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  24.43 
 
 		 687 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 730 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 735 aa  91.3  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 706 aa  90.9  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  23.05 
 
 		 758 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 751 aa  90.5  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  23 
 
 		 811 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.71 
 
 		 690 aa  88.6  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  24.85 
 
 		 799 aa  87.4  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 824 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 719 aa  87.4  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  22.66 
 
 		 758 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  23.69 
 
 		 714 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 719 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 758 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  22.39 
 
 		 758 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  22.68 
 
 		 758 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 705 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 709 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  21.47 
 
 		 707 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 693 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 695 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 698 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 784 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.11 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  22.47 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 783 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.1 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 676 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  27.91 
 
 		 681 aa  76.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 681 aa  74.7  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  26.16 
 
 		 697 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.94 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00089  putative outer membrane receptor protein  39.74 
 
 		 87 aa  67.8  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 695 aa  67.4  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  30.9 
 
 		 778 aa  67.4  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.3 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.1 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.1 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 661 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.98 
 
 		 631 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.62 
 
 		 696 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 613 aa  65.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.54 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 662 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  26.39 
 
 		 868 aa  63.9  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>