More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0909 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  100 
 
 		 276 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  63.7 
 
 		 280 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  50.18 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  51.49 
 
 		 280 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  45.96 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  51.85 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  50.38 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  48.5 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  45.77 
 
 		 306 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  46.57 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.83 
 
 		 285 aa  214  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  44.04 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.7 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.19 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.83 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.2 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  28.88 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.36 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  28.37 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.8 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.18 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  24.9 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  26.25 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.04 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  37 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  25.67 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  28.8 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.41 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  20.4 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  20.4 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  29.14 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  29.14 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  29.14 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  29.14 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>