251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1244 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1244  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 658 aa  1340    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0059  tetratricopeptide repeat domain protein  24.1 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.19 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 4079 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.79 
 
 		 1694 aa  63.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.74 
 
 		 2401 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 909 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.08 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.99 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1676 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  24.29 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.18 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.38 
 
 		 733 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 3035 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 		 383 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.15 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  23.61 
 
 		 614 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.68 
 
 		 935 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  21 
 
 		 968 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1276 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.07 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1192 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 927 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.75 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.37 
 
 		 837 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 632 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 589 aa  56.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 714 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 2262 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  25.41 
 
 		 673 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.11 
 
 		 639 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.01 
 
 		 1737 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.17 
 
 		 884 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.62 
 
 		 762 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 		 406 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  23.62 
 
 		 762 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 627 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  22.95 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 827 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.59 
 
 		 864 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 750 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1178 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 542 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  23.5 
 
 		 436 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 1421 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.91 
 
 		 1486 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  26.13 
 
 		 929 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.47 
 
 		 624 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 591 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 505 aa  54.7  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 243 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 697 aa  54.7  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 643 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 1406 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 200 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1138 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 354 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 3145 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.05 
 
 		 603 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 599 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 637 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.77 
 
 		 1764 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 		 553 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 4489 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 934 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 647 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.7 
 
 		 875 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 453 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 		 1067 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 562 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 465 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 		 1073 aa  52.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.99 
 
 		 676 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  24.45 
 
 		 1077 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  24.24 
 
 		 398 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 732 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.42 
 
 		 1007 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 1049 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.47 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.1 
 
 		 832 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 		 615 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1180 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 		 366 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1094 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.08 
 
 		 707 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  32.59 
 
 		 815 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>