182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0564 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0564  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 424 aa  875    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03626  hypothetical protein  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002434  deacetylase DA1  67.14 
 
 		 427 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0899  hypothetical protein  64.55 
 
 		 431 aa  594  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1411  polysaccharide deacetylase  53.08 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2943  polysaccharide deacetylase  53.08 
 
 		 375 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  53.08 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1438  polysaccharide deacetylase  53.08 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  32 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  31.46 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  45.83 
 
 		 201 aa  57  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  40.58 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  40.58 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  35.37 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  34.88 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  35.37 
 
 		 324 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 280 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 192 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 264 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  34.88 
 
 		 305 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  35.14 
 
 		 320 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.95 
 
 		 481 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 345 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  41.03 
 
 		 242 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 321 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  40.28 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  43.94 
 
 		 352 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 215 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 258 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1697  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 191 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 301 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  33.96 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 234 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 331 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 		 353 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  27.22 
 
 		 247 aa  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  39.19 
 
 		 240 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 263 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.82 
 
 		 275 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  40.85 
 
 		 237 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  37.33 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  36 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5060  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 194 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0405  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 234 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  34.21 
 
 		 211 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  38.67 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  38.67 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.62 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 244 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 1154 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.85 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.14 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 542 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  43.75 
 
 		 300 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 217 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 275 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 		 752 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.33 
 
 		 280 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  36.84 
 
 		 162 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.53 
 
 		 251 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 243 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>