More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4039 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  100 
 
 		 401 aa  760    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  91.02 
 
 		 401 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  55.5 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  57.36 
 
 		 393 aa  342  8e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  57.18 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  56.05 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  51.55 
 
 		 389 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  55.61 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  55.61 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  55.96 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  57.42 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  57.49 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  54.03 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  59.29 
 
 		 415 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  54.42 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  51.85 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  62.39 
 
 		 400 aa  309  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  55.76 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  55.24 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  64.26 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  55.3 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  58.47 
 
 		 398 aa  298  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  57.91 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  56.98 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  56.03 
 
 		 379 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.81 
 
 		 378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  52.49 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  49.1 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.49 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  56.74 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  45.85 
 
 		 463 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  47.46 
 
 		 462 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  55.79 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  47.46 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  48.12 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  47.99 
 
 		 523 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  48.44 
 
 		 520 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  48.44 
 
 		 520 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  48.44 
 
 		 520 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  48.44 
 
 		 523 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  47.78 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  45.82 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  54.84 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  46.23 
 
 		 624 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  46.1 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.18 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  45.42 
 
 		 467 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.46 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  47.3 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  50.13 
 
 		 492 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  52.31 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39.02 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  45.12 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  45.08 
 
 		 472 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 472 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  43.2 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 474 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  43.07 
 
 		 456 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  45.33 
 
 		 428 aa  255  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 472 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  45.48 
 
 		 445 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  43.13 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 455 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 455 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  44.85 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  41.57 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  46.05 
 
 		 474 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  43.89 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  44.85 
 
 		 634 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  42.02 
 
 		 572 aa  249  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  42.02 
 
 		 569 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  41.23 
 
 		 479 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  43.67 
 
 		 594 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  43.89 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  44.37 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 454 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 476 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 454 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  45.08 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  45.08 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 484 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  41.53 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  39.58 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  44.19 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  43.16 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  44.37 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  42.81 
 
 		 589 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  47 
 
 		 608 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  45.17 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  44.48 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.17 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  48.62 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  41.26 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  43.54 
 
 		 491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.17 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>