224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0327 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  362  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  58.1 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  59.55 
 
 		 197 aa  214  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  60.22 
 
 		 200 aa  214  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  55.62 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 241 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 254 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  28.24 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  20.16 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  36.92 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  29.85 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.51 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  18.5 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  34.43 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.23 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  35.09 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  20.15 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  20.15 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  28.41 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>