More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3068 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  100 
 
 		 516 aa  1061    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  49.7 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  49.39 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  46.25 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  41.58 
 
 		 533 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 522 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  41.25 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  42.83 
 
 		 548 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  42.06 
 
 		 522 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  41.65 
 
 		 522 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2785  diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 519 aa  332  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  38.93 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  35.31 
 
 		 555 aa  329  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  34.08 
 
 		 528 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  36.17 
 
 		 534 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  37.78 
 
 		 518 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1221  diguanylate cyclase  35.27 
 
 		 519 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  34.74 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  34.06 
 
 		 505 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  32.86 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  33.6 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  33.6 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  33.87 
 
 		 503 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 516 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  33.53 
 
 		 510 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  33.6 
 
 		 492 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  31.8 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  33.2 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  33.2 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  33.4 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  34.13 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  32.66 
 
 		 492 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  33.87 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 521 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  32.45 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  30.63 
 
 		 508 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  33.87 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  33.87 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  35.21 
 
 		 510 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  34.74 
 
 		 529 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  30.82 
 
 		 474 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  34.05 
 
 		 512 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  34.22 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  33.4 
 
 		 492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  33.67 
 
 		 492 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  34.12 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  33.27 
 
 		 528 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  33.81 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  33.4 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  33.4 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  33.4 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  33.4 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1243  diguanylate cyclase  33.9 
 
 		 510 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  35.21 
 
 		 510 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  33.4 
 
 		 487 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  33.2 
 
 		 487 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  31.98 
 
 		 505 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  31.98 
 
 		 505 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  34.18 
 
 		 507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 506 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  32.74 
 
 		 508 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  31.49 
 
 		 524 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  34 
 
 		 502 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  34.75 
 
 		 509 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  32.25 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  29.84 
 
 		 506 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  31.83 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  30.21 
 
 		 506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  30.02 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  30.02 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  30.02 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  30.02 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  30.02 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  30.22 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0832  diguanylate cyclase  34.1 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  31.08 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  30.16 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  31.51 
 
 		 501 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  30.62 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  29.8 
 
 		 493 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0821  diguanylate cyclase  33.41 
 
 		 496 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605291  normal  0.227561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  30 
 
 		 480 aa  203  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  33.49 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 506 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  33.41 
 
 		 502 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  29.68 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  29.71 
 
 		 504 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1127  GGDEF domain-containing protein  29.61 
 
 		 572 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00567617  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3174  diguanylate cyclase  29.67 
 
 		 530 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0610  two component response regulator  50.85 
 
 		 649 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>