245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1294 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  36.81 
 
 
190 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
190 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
190 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  31.91 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  30.53 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  32.77 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  33.56 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  25.95 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.27 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 
228 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.98 
 
 
533 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.12 
 
 
214 aa  61.6  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  26.2 
 
 
228 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 
234 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.04 
 
 
228 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  25.13 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 
226 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  24.6 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  27.72 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
185 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
232 aa  58.2  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 
217 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  26.14 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  22.99 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
205 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  25.53 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 
231 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 
231 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 
231 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 
377 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
224 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  25.54 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  23.4 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 
233 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  22.46 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  24.35 
 
 
389 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.54 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  23.56 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  29.26 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 
234 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  25.49 
 
 
227 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>