More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4136 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 399 aa  808    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  48.88 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.49 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  44.33 
 
 		 401 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  39 
 
 		 423 aa  275  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  40.46 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  32.64 
 
 		 398 aa  202  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  30.62 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  31.74 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.81 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  30.35 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 		 394 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  28.8 
 
 		 406 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  27.2 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  26.37 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  29.33 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 395 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  28.3 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  25.69 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 		 395 aa  96.3  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.61 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.61 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  22.52 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  23.76 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  23.93 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 392 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  24.04 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  23.23 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  24.37 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  24.37 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  24.37 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.25 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  23.87 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0667  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  25.94 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>