More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1938 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  42.01 
 
 		 776 aa  637    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 801 aa  1639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  41.46 
 
 		 776 aa  592  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 		 678 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 780 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  31.46 
 
 		 799 aa  350  6e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 759 aa  319  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 763 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 818 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 824 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 735 aa  217  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  25.61 
 
 		 811 aa  204  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 730 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 682 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 699 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 681 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 685 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 692 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 681 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 709 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 693 aa  124  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  24.46 
 
 		 687 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  23.57 
 
 		 681 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  24.75 
 
 		 687 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 694 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 685 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 702 aa  110  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 689 aa  104  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 714 aa  104  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 733 aa  98.2  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 760 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 719 aa  93.6  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.49 
 
 		 687 aa  92.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 695 aa  92  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 727 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 727 aa  89  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 706 aa  87.8  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 707 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 693 aa  82.8  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 744 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 835 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  40.71 
 
 		 719 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  40.71 
 
 		 719 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  29.38 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 742 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 682 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 713 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  36.29 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 724 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 779 aa  74.3  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 725 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 734 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 753 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  34.07 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  22.2 
 
 		 801 aa  71.2  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  22 
 
 		 744 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 897 aa  70.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25.56 
 
 		 872 aa  70.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 714 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 705 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.35 
 
 		 600 aa  70.1  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 730 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 731 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 694 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 723 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 757 aa  68.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1075 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 709 aa  68.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1066 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 698 aa  67.8  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 683 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 702 aa  66.6  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 751 aa  65.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 		 758 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.98 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  20.69 
 
 		 757 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 957 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 791 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00089  putative outer membrane receptor protein  39.73 
 
 		 87 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.08 
 
 		 688 aa  63.9  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>