More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  100 
 
 
577 aa  1149    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.53 
 
 
486 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  46.22 
 
 
539 aa  355  1e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0433  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.48 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000434978  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  45.71 
 
 
453 aa  230  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  44.25 
 
 
484 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.68 
 
 
535 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  43.99 
 
 
467 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  43.32 
 
 
492 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  42.86 
 
 
485 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  43.57 
 
 
514 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  44.6 
 
 
491 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  42.49 
 
 
502 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  42.49 
 
 
502 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  42.49 
 
 
502 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  42.49 
 
 
461 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  42.49 
 
 
485 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  42.49 
 
 
502 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  42.49 
 
 
502 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  42.96 
 
 
493 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  45.49 
 
 
511 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  41.36 
 
 
489 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  41.18 
 
 
487 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.38 
 
 
474 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  41.36 
 
 
498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  41.16 
 
 
505 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  42.67 
 
 
503 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  42.24 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.56 
 
 
472 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.96 
 
 
513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  39.86 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  39.1 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.98 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  42.2 
 
 
508 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  42.01 
 
 
473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.03 
 
 
474 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.07 
 
 
452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.67 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  42.96 
 
 
503 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  43.22 
 
 
503 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  41.52 
 
 
488 aa  213  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  45.09 
 
 
473 aa  213  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  39.93 
 
 
498 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  39.93 
 
 
498 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  39.93 
 
 
498 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42.39 
 
 
471 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  40.43 
 
 
490 aa  213  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  41.26 
 
 
473 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  41.52 
 
 
493 aa  213  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  40.43 
 
 
476 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  41.03 
 
 
500 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  41.43 
 
 
474 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.57 
 
 
398 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  39.23 
 
 
481 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  40.66 
 
 
499 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  38.61 
 
 
505 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  41.02 
 
 
578 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.89 
 
 
504 aa  211  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  43.21 
 
 
504 aa  211  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.34 
 
 
415 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  40.66 
 
 
499 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  39.3 
 
 
471 aa  210  6e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  42.14 
 
 
491 aa  210  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.18 
 
 
471 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.48 
 
 
455 aa  209  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.39 
 
 
588 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  41.38 
 
 
402 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.36 
 
 
383 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  42.03 
 
 
404 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  41.38 
 
 
388 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 
477 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 
477 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  42.03 
 
 
404 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  41.03 
 
 
473 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.75 
 
 
398 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  41.38 
 
 
402 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  37.71 
 
 
456 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.24 
 
 
478 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  41.38 
 
 
402 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  41.34 
 
 
403 aa  208  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  39.93 
 
 
502 aa  208  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.56 
 
 
500 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.86 
 
 
408 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  41.38 
 
 
402 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  40.28 
 
 
385 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  41.38 
 
 
402 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  40.5 
 
 
489 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.06 
 
 
511 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  39 
 
 
501 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  36.34 
 
 
462 aa  207  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.3 
 
 
449 aa  207  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  38.71 
 
 
498 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.5 
 
 
408 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  41.76 
 
 
516 aa  207  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.37 
 
 
386 aa  207  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.34 
 
 
388 aa  207  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  40.42 
 
 
520 aa  207  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  38.41 
 
 
507 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  36.57 
 
 
396 aa  206  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  41.3 
 
 
500 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>