158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09190  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 455 aa  929    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.216592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06050  tetratricopeptide repeat protein  57.11 
 
 		 456 aa  529  1e-149  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.807535  hitchhiker  0.00000000184751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1251  TPR repeat-containing protein  60.74 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0669  Tetratricopeptide domain protein  33.7 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.774864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.12 
 
 		 626 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.01 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 		 1013 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 927 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.54 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 1486 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 2240 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.54 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.54 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 689 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.72 
 
 		 1694 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.09 
 
 		 832 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 654 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.63 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 3560 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 732 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.85 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 686 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 		 209 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 254 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.43 
 
 		 2327 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 317 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 3035 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 562 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 4079 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.4 
 
 		 810 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 615 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 878 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 667 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.65 
 
 		 620 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 1737 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 979 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1069 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25.82 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  24.67 
 
 		 299 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 864 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.85 
 
 		 733 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1276 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 		 1252 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 576 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 597 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 716 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 547 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 		 1252 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  30.67 
 
 		 299 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 714 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 271 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 589 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.52 
 
 		 2145 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.83 
 
 		 1154 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 739 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.58 
 
 		 1007 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.82 
 
 		 730 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.71 
 
 		 887 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  28.74 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 740 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 		 565 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 3301 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.89 
 
 		 784 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 952 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1274 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1421 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 636 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  26.91 
 
 		 566 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  24.28 
 
 		 682 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 		 992 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 632 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1406 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  26.7 
 
 		 985 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.56 
 
 		 828 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 637 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  23.5 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1827 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 718 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.35 
 
 		 1266 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>