More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3382 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.48 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  47 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.85 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.08 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  46.08 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.16 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.08 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.16 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.16 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  42.4 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.93 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  47 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  43.33 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.25 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.23 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.1 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  43.7 
 
 		 257 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.68 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.02 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.96 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.85 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.12 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.08 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  35.18 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.18 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 		 272 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.65 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  31.44 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  31.4 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  31.84 
 
 		 261 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 272 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  31.84 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  34.17 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.76 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.1 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  31.4 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 233 aa  91.3  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 254 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 254 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.02 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.17 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.19 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 		 461 aa  89  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 251 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>