240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0200 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0200  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 343 aa  697    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  58.6 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  57.89 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  57.18 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  52.63 
 
 		 344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  50.42 
 
 		 364 aa  331  9e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  49.86 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  49.58 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  49.58 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0903  ipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 376 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  29.75 
 
 		 383 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  30.45 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  30.33 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  31.45 
 
 		 380 aa  142  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  30.99 
 
 		 370 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  28.91 
 
 		 388 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  29.48 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  29.48 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  31.18 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  31.48 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  31.23 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  29.66 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  29.43 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  29.49 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  33.21 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  30.09 
 
 		 371 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 380 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.14 
 
 		 376 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  32.79 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  30.35 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.14 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31.18 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  32.09 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  36.12 
 
 		 372 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  31.25 
 
 		 384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  29.46 
 
 		 384 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 397 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.4 
 
 		 393 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  30.97 
 
 		 380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  30.94 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  28.53 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.59 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  33.7 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  27.86 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  30.84 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  28.19 
 
 		 382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  31.42 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  29.54 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  30.23 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  29.78 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  30.51 
 
 		 393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  28 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  29.78 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  32.96 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  29.25 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.12 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.39 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  34.16 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  28.19 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  28.65 
 
 		 388 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.44 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  30.1 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  30.25 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  31.77 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  29.3 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 393 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 380 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  30.55 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 		 390 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  29.59 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  30.45 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  30.72 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  28.1 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.84 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  27.84 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  29.21 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  29.36 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  29.75 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30.55 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  30.71 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  28.41 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  28.78 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  29.76 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>