More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4578 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2937  UspA domain protein  44.44 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.62 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.03 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  35.25 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.66 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.22 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  41.77 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.95 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.69 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.37 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  37.31 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  36.73 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.06 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  44.07 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  34.88 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.3 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  31.88 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  48.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.21 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  31.33 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.31 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  42.86 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.59 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  45 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.33 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  40.15 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.94 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  36.48 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  34.27 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 153 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  33.56 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.5 
 
 		 169 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  36.44 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  32.37 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  43.28 
 
 		 148 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 141 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  30.28 
 
 		 151 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  30.28 
 
 		 151 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.19 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  35.71 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  33.81 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  28.57 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  46.38 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  45.16 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.09 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 161 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  24.49 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.9 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  46.77 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.55 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  42.17 
 
 		 138 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  45.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  35.56 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  47.76 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  39.39 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1583  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.932581  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  33.83 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.33 
 
 		 168 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  27.12 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  51.67 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  32.39 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  32.12 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  47.17 
 
 		 150 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  41.94 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  45.59 
 
 		 159 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  33.85 
 
 		 133 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  42.62 
 
 		 152 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  35.22 
 
 		 164 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  49.18 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  41.98 
 
 		 282 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 156 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  34.27 
 
 		 156 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  43.33 
 
 		 154 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 156 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  26.97 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  29.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  45.9 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>