More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1081 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1081  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 602 aa  1198    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.869839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  33.67 
 
 		 784 aa  180  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  33.67 
 
 		 784 aa  180  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  37.28 
 
 		 704 aa  180  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  39.63 
 
 		 692 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.43 
 
 		 874 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.35 
 
 		 718 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  39.46 
 
 		 718 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  37.24 
 
 		 729 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  37.72 
 
 		 944 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  34 
 
 		 726 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  37.41 
 
 		 714 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  36.06 
 
 		 710 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  32.5 
 
 		 420 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.76 
 
 		 894 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  33.33 
 
 		 706 aa  153  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  34.29 
 
 		 420 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  40.31 
 
 		 926 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  35.13 
 
 		 698 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  35.13 
 
 		 698 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  37.85 
 
 		 422 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  37.05 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  35.19 
 
 		 682 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  39.53 
 
 		 946 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  38.43 
 
 		 870 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  30.64 
 
 		 711 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.74 
 
 		 706 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  35.59 
 
 		 891 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  32.09 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  33.44 
 
 		 706 aa  145  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  31.5 
 
 		 710 aa  145  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  36.64 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  36.09 
 
 		 717 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  31.23 
 
 		 714 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  33.92 
 
 		 696 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  34.25 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  34.83 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  33.57 
 
 		 696 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  34.35 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  31.42 
 
 		 716 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  33.8 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  34.34 
 
 		 578 aa  142  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  37.16 
 
 		 893 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  31.03 
 
 		 710 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  34.74 
 
 		 683 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  34.74 
 
 		 683 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  34.74 
 
 		 683 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  34.74 
 
 		 683 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  34.49 
 
 		 683 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  31.56 
 
 		 717 aa  140  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  32.87 
 
 		 682 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  35.94 
 
 		 349 aa  140  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  35.23 
 
 		 580 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  34.16 
 
 		 684 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  33.81 
 
 		 684 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  34.15 
 
 		 684 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  30.33 
 
 		 715 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  34.81 
 
 		 591 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  34.05 
 
 		 689 aa  138  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  33.78 
 
 		 710 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.8 
 
 		 684 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  34.15 
 
 		 683 aa  137  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  30.55 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  33.78 
 
 		 553 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  35.48 
 
 		 987 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1027  type II and III secretion system protein  32.72 
 
 		 552 aa  137  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40658 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  32.75 
 
 		 636 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  32.42 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  31.88 
 
 		 712 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  31.62 
 
 		 524 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.23 
 
 		 685 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  35.5 
 
 		 887 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  33.57 
 
 		 688 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  34.15 
 
 		 683 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  35.09 
 
 		 668 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  34.24 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  35.5 
 
 		 887 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  33.56 
 
 		 371 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  32.38 
 
 		 694 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  35.44 
 
 		 864 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  32.65 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  32.65 
 
 		 462 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  32.65 
 
 		 462 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  32.65 
 
 		 462 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  33.33 
 
 		 682 aa  134  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  32.53 
 
 		 543 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  32.65 
 
 		 527 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  32.83 
 
 		 538 aa  133  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  33.56 
 
 		 543 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  35.11 
 
 		 882 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  27.11 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  32.65 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  32.65 
 
 		 616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  30.94 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  32.26 
 
 		 711 aa  132  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  31.93 
 
 		 630 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  32.88 
 
 		 808 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  31.72 
 
 		 567 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>