More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0937 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0937  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 938 aa  1857    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0616253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  43.16 
 
 		 1183 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  42.41 
 
 		 1158 aa  546  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  44.09 
 
 		 1170 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  43.14 
 
 		 1161 aa  542  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  40.09 
 
 		 1159 aa  538  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  41.25 
 
 		 1157 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  41.25 
 
 		 1157 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  42.28 
 
 		 1189 aa  539  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  42.6 
 
 		 1162 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  42.6 
 
 		 1162 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  41.02 
 
 		 1177 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  41.09 
 
 		 1176 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1112 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  43.41 
 
 		 1054 aa  532  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1176 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1176 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1178 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1176 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1176 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1176 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1176 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1176 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  41.77 
 
 		 1112 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  42.03 
 
 		 1176 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  41.11 
 
 		 1178 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  39.94 
 
 		 1157 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1165 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  43.18 
 
 		 1165 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  42.79 
 
 		 1176 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4332  transcription-repair coupling factor  41.52 
 
 		 1241 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0186143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4487  transcription-repair coupling factor  41.36 
 
 		 1233 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  42.09 
 
 		 1155 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  41.61 
 
 		 1073 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1155 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.37 
 
 		 1246 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1158 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  40.69 
 
 		 1160 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4468  transcription-repair coupling factor  41.2 
 
 		 1241 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1157 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  41.81 
 
 		 1151 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  40.82 
 
 		 1160 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  39.47 
 
 		 1174 aa  519  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  41.04 
 
 		 1198 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1160 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  42.17 
 
 		 1177 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1164 aa  515  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4478  transcription-repair coupling factor  40.52 
 
 		 1229 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419935 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  43.17 
 
 		 1179 aa  516  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  42.21 
 
 		 1169 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  40.63 
 
 		 1157 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  44.29 
 
 		 1177 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  40.82 
 
 		 1160 aa  515  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  37.03 
 
 		 1182 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  39.77 
 
 		 1183 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1162 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  40.63 
 
 		 1149 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  34.65 
 
 		 1099 aa  509  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  38.17 
 
 		 1179 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  41.43 
 
 		 1157 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  40.73 
 
 		 1207 aa  505  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  41.51 
 
 		 1153 aa  506  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  41.51 
 
 		 1153 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1141 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  40.96 
 
 		 1178 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  40.84 
 
 		 1123 aa  505  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  41.59 
 
 		 1143 aa  503  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  38.06 
 
 		 1265 aa  505  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  39.94 
 
 		 1148 aa  503  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  39.94 
 
 		 1164 aa  502  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  39.68 
 
 		 1149 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  41.36 
 
 		 1169 aa  501  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1952  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1162 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00516748  normal  0.328047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1148 aa  501  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  41.36 
 
 		 1148 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4876  transcription-repair coupling factor  38.24 
 
 		 1257 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968673  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  39.94 
 
 		 1148 aa  503  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1148 aa  502  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  39.94 
 
 		 1148 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2406  transcription-repair coupling factor  40.16 
 
 		 1162 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00482386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  40.86 
 
 		 1103 aa  502  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1150 aa  503  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1164 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  39.11 
 
 		 1150 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1148 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  40.89 
 
 		 1121 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2395  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1162 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000829473  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  38.62 
 
 		 1179 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  40.1 
 
 		 1148 aa  502  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  40.06 
 
 		 1163 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2511  transcription-repair coupling factor  40.16 
 
 		 1165 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00100471  normal  0.47703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1141 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1197 aa  499  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1691  transcription-repair coupling factor  39.07 
 
 		 1153 aa  499  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427142  normal  0.0220248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1149 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1179 aa  499  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  41.2 
 
 		 1148 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  41.2 
 
 		 1148 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  40.59 
 
 		 1179 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  41.44 
 
 		 1168 aa  497  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>