295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1365 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  100 
 
 		 402 aa  827    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  48.51 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  38.21 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  30.45 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  33.56 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  34.24 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  33.56 
 
 		 385 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  33.56 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  30.05 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  33.9 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  33.9 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  33.9 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  33.9 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  35.05 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  33.56 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  30.58 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  31.14 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  37.12 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  35.9 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  35.53 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  29.57 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.14 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  33.88 
 
 		 390 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  29.21 
 
 		 399 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.47 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.93 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.47 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  34.77 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  34.9 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  31.62 
 
 		 383 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  33.22 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.21 
 
 		 381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  28.11 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  28.11 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  28.11 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  27.83 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  31.99 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.63 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  27.86 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  36.06 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.87 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  28.04 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  34.34 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  29.23 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  32.67 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.22 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  34.58 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  26.42 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  36.33 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  28.72 
 
 		 407 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  32.91 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  31.55 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.17 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.94 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.68 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  27.48 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  29.34 
 
 		 393 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  33.89 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  26.45 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  27.61 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  25.61 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  31.02 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.32 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.32 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  26.89 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.33 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  30.04 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  30.53 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  28.03 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  31.71 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  31.44 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.15 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  28.15 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  31.42 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.78 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  26.63 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  27.68 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  30.38 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  26.6 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  27.36 
 
 		 425 aa  99.4  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  25.62 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  23.61 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  29.31 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  27.06 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  24.75 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  24.33 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  27.09 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.18 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  26.62 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  26.91 
 
 		 517 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  30.3 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  25.27 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  24.09 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  28.88 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  24.09 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  24.85 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  26.89 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  24.09 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>