138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1982 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 149 aa  306  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  78.32 
 
 		 145 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  78.01 
 
 		 158 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  61.24 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  60.77 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  34.78 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  34.85 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  35.54 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  27.81 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  29.91 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  37.84 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  34.74 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  30.22 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  26.4 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.1 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  31.86 
 
 		 238 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.61 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  30.09 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  27.41 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  30.09 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  30.09 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.04 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  30.09 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.98 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  30.09 
 
 		 248 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  35.23 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  31.91 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.23 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  33.72 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  27.55 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  30.97 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  20.18 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.04 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.3 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  21.93 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  30.4 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  35.16 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.53 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.99 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.47 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  38.1 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 		 209 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  26.85 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  26.85 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>