More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0533 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 338 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  90.53 
 
 		 338 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  63.45 
 
 		 343 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  57.23 
 
 		 339 aa  348  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  40.91 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 346 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  43.46 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  39.58 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  43.71 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  39.58 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  40.42 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  37.28 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.4 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  38.54 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  36.11 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  41.54 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  40.24 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.36 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  34.26 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  36.36 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  35.11 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  34.81 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.61 
 
 		 364 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.84 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  36.2 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  40.98 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  36.33 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  40.96 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  41.26 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  38.71 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  41.9 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  39.5 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  40.47 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  39.22 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  34.84 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  32.84 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  34.26 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  32.19 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  34.41 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  38.25 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  41.01 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  36.78 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  34.26 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  39.02 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  36.89 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  40.34 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.68 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  36.73 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.64 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  33.22 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  37.16 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.09 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.19 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  36.57 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.71 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.16 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  36.6 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.16 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  39.63 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  39.47 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  39.47 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  39.41 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.68 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.82 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  39.48 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  36.06 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.68 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  39.06 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.14 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  40.19 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  36.97 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  36.6 
 
 		 300 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  35.68 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  36.19 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  35.81 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  32.9 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.01 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.25 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  37.32 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  37.12 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>