More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0116 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  90.14 
 
 		 416 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 416 aa  840    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  56.17 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  41.32 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 		 413 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 427 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 427 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  36.39 
 
 		 420 aa  262  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  34.67 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  38.88 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  35.84 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  34.61 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  36.75 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  37.44 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  35.15 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 427 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  35.82 
 
 		 435 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.18 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  34.04 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  36.24 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  34.81 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  35.77 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  35.77 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  36.58 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.94 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  33.42 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  34.34 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  34.09 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  30.9 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  31.09 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.65 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  32.7 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 411 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  31.87 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  32.3 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  33.18 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  32.69 
 
 		 418 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.88 
 
 		 416 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  31.03 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  30.95 
 
 		 417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  29.64 
 
 		 416 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  30.24 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 410 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  30.38 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.33 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.98 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 421 aa  159  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.14 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  30.79 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  31.41 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 415 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.93 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  31.12 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.02 
 
 		 416 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>