More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4422 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4422  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5209  TPR repeat-containing protein  41.91 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.290651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0937  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376157  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.01 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0931  TPR repeat protein  36.5 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.836248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0934  TPR repeat protein  36.13 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0883  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.326054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  27.88 
 
 		 377 aa  85.5  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 878 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 681 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 685 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3247  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.57 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405912  normal  0.391395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 979 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 909 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 739 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.79 
 
 		 764 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.97 
 
 		 725 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.15 
 
 		 622 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.82 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.09 
 
 		 816 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 		 632 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 374 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 601 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.81 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.62 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 626 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  35 
 
 		 795 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 4489 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 620 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 3560 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 3035 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1421 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.48 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  26.42 
 
 		 779 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 808 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 611 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.97 
 
 		 733 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.91 
 
 		 780 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  33.06 
 
 		 587 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 626 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0419  hypothetical protein  30.91 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.831767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 		 714 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 605 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 779 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 614 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.24 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 406 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.17 
 
 		 714 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.47 
 
 		 837 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 614 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  37.36 
 
 		 865 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 1034 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 406 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 795 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 689 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1450 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 637 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 636 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 1385 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 718 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 612 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  38.66 
 
 		 541 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 3145 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1138 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 639 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 760 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 486 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  34 
 
 		 545 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1406 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 565 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  28.35 
 
 		 682 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>