113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0018 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  100 
 
 		 1204 aa  2442    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  59.39 
 
 		 1156 aa  1197    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  53.41 
 
 		 1115 aa  1010    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3655  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1272 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.851877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0795  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1140 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2495  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1140 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.963407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2989  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1140 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000392845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1798  ImcF domain-containing protein  33.51 
 
 		 1067 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2591  ImcF domain-containing protein  34.98 
 
 		 1140 aa  559  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2911  ImcF domain-containing protein  34.39 
 
 		 1094 aa  555  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.951042  normal  0.253398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3247  ImcF domain-containing protein  34.73 
 
 		 1114 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  26.5 
 
 		 1301 aa  211  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.3 
 
 		 1288 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1297 aa  207  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1297 aa  207  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1297 aa  207  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1297 aa  207  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1297 aa  207  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1297 aa  207  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1297 aa  207  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  27.89 
 
 		 1268 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  27.87 
 
 		 1313 aa  198  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  27.87 
 
 		 1313 aa  198  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1315 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  27.7 
 
 		 1314 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  27.7 
 
 		 1314 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  27.54 
 
 		 1315 aa  193  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  27.7 
 
 		 1314 aa  192  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  27.05 
 
 		 1265 aa  191  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1270 aa  186  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1267 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  27.17 
 
 		 1267 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1310 aa  173  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  24.92 
 
 		 1335 aa  173  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1195 aa  172  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  24.59 
 
 		 1230 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1313 aa  156  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  23.09 
 
 		 1207 aa  85.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1176 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1102 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  22.81 
 
 		 1171 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  20.73 
 
 		 1177 aa  73.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  20.73 
 
 		 1177 aa  73.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  21.37 
 
 		 1164 aa  72.4  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1175 aa  72  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1164 aa  71.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1174 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  21 
 
 		 1192 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  22.56 
 
 		 1153 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1174 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1153 aa  70.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1175 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1168 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  22.73 
 
 		 1165 aa  67.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1179 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  22.03 
 
 		 1179 aa  65.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  21.31 
 
 		 1211 aa  63.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  21.94 
 
 		 1220 aa  63.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  23.97 
 
 		 1157 aa  63.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  19.69 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  21.56 
 
 		 1302 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  23.31 
 
 		 1205 aa  62.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.99 
 
 		 1165 aa  61.6  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  22.49 
 
 		 1212 aa  61.6  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  22.53 
 
 		 1165 aa  61.6  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  21.23 
 
 		 1302 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  26.49 
 
 		 830 aa  59.3  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  20.03 
 
 		 1008 aa  58.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  21.52 
 
 		 1182 aa  58.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1167 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1167 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1167 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1167 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1147 aa  58.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  20.13 
 
 		 1187 aa  58.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1205 aa  57.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1104 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  27.78 
 
 		 1164 aa  57.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  28.15 
 
 		 728 aa  57  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  21.96 
 
 		 1302 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  21.64 
 
 		 1302 aa  55.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  21.15 
 
 		 1199 aa  55.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  21.64 
 
 		 1302 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  23.23 
 
 		 1206 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  22.08 
 
 		 1218 aa  53.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  23.15 
 
 		 1175 aa  52.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  21.61 
 
 		 1348 aa  52.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  22.3 
 
 		 1209 aa  52.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  24.11 
 
 		 830 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1369 aa  51.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  19.77 
 
 		 1182 aa  51.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1206 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  20.89 
 
 		 1302 aa  50.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  22.64 
 
 		 1317 aa  50.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  23.3 
 
 		 1194 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  23.49 
 
 		 1365 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 1194 aa  49.3  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  21.37 
 
 		 1268 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  20.89 
 
 		 973 aa  47.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  20.89 
 
 		 973 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>