126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0730 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  99.86 
 
 		 1147 aa  1483    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  99.86 
 
 		 1104 aa  1486    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  98.76 
 
 		 1164 aa  1472    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1494    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  99.86 
 
 		 1167 aa  1485    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  99.86 
 
 		 1167 aa  1485    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  99.86 
 
 		 1167 aa  1485    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  99.86 
 
 		 1167 aa  1485    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  36.4 
 
 		 1164 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  36.4 
 
 		 1164 aa  485  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  28.05 
 
 		 1199 aa  244  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  28.48 
 
 		 1211 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  28.98 
 
 		 1220 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  28.81 
 
 		 1209 aa  231  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1208 aa  230  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1176 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1102 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  27.95 
 
 		 1209 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  27.95 
 
 		 1209 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  28.02 
 
 		 1218 aa  218  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 1209 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 1209 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 1209 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  27.95 
 
 		 1209 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  26.63 
 
 		 1365 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  27.95 
 
 		 1209 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 1209 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1369 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  25.86 
 
 		 1366 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  27.19 
 
 		 1365 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.92 
 
 		 1171 aa  208  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  26.68 
 
 		 1348 aa  208  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1205 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  24.53 
 
 		 1212 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  27.13 
 
 		 1358 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  27.13 
 
 		 1358 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  27.13 
 
 		 1358 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  25.36 
 
 		 1329 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  27.11 
 
 		 1317 aa  200  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1332 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 1302 aa  195  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  26.29 
 
 		 1302 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  26.44 
 
 		 1302 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  27.09 
 
 		 1289 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  27.09 
 
 		 1289 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.75 
 
 		 1302 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  27.09 
 
 		 1289 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  26.29 
 
 		 1302 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  27.09 
 
 		 1289 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  26.24 
 
 		 1302 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.13 
 
 		 1207 aa  184  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  25.41 
 
 		 1268 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1275 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  24.51 
 
 		 1275 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  23.15 
 
 		 1172 aa  162  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  23.15 
 
 		 1182 aa  160  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  24.59 
 
 		 1175 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  25.08 
 
 		 1150 aa  141  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  24.66 
 
 		 1157 aa  133  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  26.38 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  26.38 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  24.27 
 
 		 1130 aa  127  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  20.57 
 
 		 1181 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  22.78 
 
 		 1181 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  23.13 
 
 		 1179 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1008 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  23.1 
 
 		 1164 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1179 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1173 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  23.16 
 
 		 1206 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  25.11 
 
 		 1173 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  23 
 
 		 1192 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  23.38 
 
 		 1205 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1175 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  22.09 
 
 		 1194 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1208 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  23.89 
 
 		 1204 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1175 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1129 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  23.43 
 
 		 1148 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  21.96 
 
 		 1182 aa  108  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1206 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  20.03 
 
 		 1187 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1153 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  21.46 
 
 		 1153 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1174 aa  101  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1168 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1174 aa  99  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  24.24 
 
 		 1152 aa  98.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  23.22 
 
 		 1176 aa  97.8  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 1194 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  20.9 
 
 		 1177 aa  87.8  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  20.9 
 
 		 1177 aa  87.8  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  20.49 
 
 		 1165 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  20.8 
 
 		 1165 aa  79  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  20.51 
 
 		 1165 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  23.13 
 
 		 973 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  23.13 
 
 		 973 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  30.73 
 
 		 890 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  30.73 
 
 		 890 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>