106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1798 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2911  ImcF domain-containing protein  45.1 
 
 		 1094 aa  860    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.951042  normal  0.253398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0795  hypothetical protein  62.42 
 
 		 1140 aa  1288    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2495  hypothetical protein  63.79 
 
 		 1140 aa  1307    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1798  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1067 aa  2168    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2989  hypothetical protein  63.79 
 
 		 1140 aa  1306    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000392845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2591  ImcF domain-containing protein  63.69 
 
 		 1140 aa  1305    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3247  ImcF domain-containing protein  46.99 
 
 		 1114 aa  891    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1156 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  35.74 
 
 		 1115 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1204 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3655  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1272 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.851877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  24.51 
 
 		 1268 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1195 aa  164  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1310 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  25 
 
 		 1267 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  23.73 
 
 		 1265 aa  158  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  24.8 
 
 		 1267 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  23.34 
 
 		 1313 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  23.34 
 
 		 1313 aa  154  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1315 aa  152  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  24.69 
 
 		 1335 aa  152  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  23.34 
 
 		 1314 aa  151  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  23.34 
 
 		 1314 aa  151  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  23.34 
 
 		 1314 aa  151  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  23.88 
 
 		 1301 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  23.53 
 
 		 1315 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  22.69 
 
 		 1288 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1297 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1297 aa  148  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1297 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1297 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1297 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1297 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1297 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1270 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  22.13 
 
 		 1230 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1313 aa  124  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1176 aa  102  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0163  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1147 aa  99.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.137975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1179 aa  99  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1192 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1102 aa  94.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1175 aa  91.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1175 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1168 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  19.96 
 
 		 1129 aa  84.7  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  20.38 
 
 		 1130 aa  83.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  22.43 
 
 		 1220 aa  82  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  20.73 
 
 		 1171 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1164 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  22.32 
 
 		 1164 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1275 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  20.7 
 
 		 1275 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  20.79 
 
 		 1199 aa  71.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1174 aa  71.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1174 aa  71.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  20.9 
 
 		 1153 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1153 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1008 aa  67.8  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  22.7 
 
 		 1179 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  21.93 
 
 		 1211 aa  65.1  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  22.2 
 
 		 1176 aa  65.1  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  23.42 
 
 		 1182 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  19.93 
 
 		 1177 aa  62.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  19.93 
 
 		 1177 aa  62.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  21.46 
 
 		 1172 aa  61.6  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  20.43 
 
 		 1302 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  20.55 
 
 		 1187 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  23.46 
 
 		 1204 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  21.62 
 
 		 1165 aa  56.6  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  21.74 
 
 		 1209 aa  55.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  20.73 
 
 		 1150 aa  55.1  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  21.23 
 
 		 1207 aa  54.7  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  20.25 
 
 		 1302 aa  53.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  22.97 
 
 		 1218 aa  53.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1173 aa  51.2  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  23.4 
 
 		 1182 aa  51.6  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  21.3 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  21.3 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  20.73 
 
 		 1302 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  21.3 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  21.3 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  23.83 
 
 		 1173 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  21.3 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  21.3 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  21.3 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  23.32 
 
 		 1302 aa  50.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  21.78 
 
 		 1289 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  22.84 
 
 		 1148 aa  50.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1208 aa  49.7  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  23.32 
 
 		 1302 aa  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  22.31 
 
 		 1206 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1206 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  21.76 
 
 		 1209 aa  49.3  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  26.35 
 
 		 1152 aa  48.9  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  22.16 
 
 		 1289 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  22.16 
 
 		 1289 aa  48.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  23.9 
 
 		 973 aa  47.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  23.9 
 
 		 973 aa  48.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 1194 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>