107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3247 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2911  ImcF domain-containing protein  45.34 
 
 		 1094 aa  826    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.951042  normal  0.253398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0795  hypothetical protein  47.84 
 
 		 1140 aa  951    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2495  hypothetical protein  48.06 
 
 		 1140 aa  967    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1798  ImcF domain-containing protein  46.99 
 
 		 1067 aa  891    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2989  hypothetical protein  48.02 
 
 		 1140 aa  964    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000392845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2591  ImcF domain-containing protein  48.11 
 
 		 1140 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3247  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1114 aa  2232    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  35.89 
 
 		 1156 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3655  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1272 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.851877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  34.77 
 
 		 1204 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  35.23 
 
 		 1115 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1310 aa  178  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  25.92 
 
 		 1268 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  25.96 
 
 		 1265 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1267 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  25.54 
 
 		 1335 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  23.85 
 
 		 1230 aa  164  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  25.38 
 
 		 1267 aa  164  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  24.19 
 
 		 1313 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  24.35 
 
 		 1315 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  24.19 
 
 		 1313 aa  160  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  24.19 
 
 		 1314 aa  159  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  24.19 
 
 		 1314 aa  159  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  24.19 
 
 		 1314 aa  159  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1315 aa  158  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  24.23 
 
 		 1301 aa  156  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1297 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1195 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  23.99 
 
 		 1288 aa  153  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1270 aa  141  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1313 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1176 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1102 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0163  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1147 aa  85.9  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.137975  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  22 
 
 		 1172 aa  79.7  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  21.21 
 
 		 1211 aa  79.7  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  25.08 
 
 		 1199 aa  78.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1205 aa  76.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1208 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1275 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  21.73 
 
 		 1275 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  21.15 
 
 		 1171 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1174 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  22.86 
 
 		 1209 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  22.64 
 
 		 1218 aa  71.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1174 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1179 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1168 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  20.96 
 
 		 1177 aa  68.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  20.96 
 
 		 1177 aa  68.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  19.7 
 
 		 1008 aa  67.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  22.51 
 
 		 1212 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1192 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  20.26 
 
 		 1129 aa  66.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  19.94 
 
 		 1130 aa  65.1  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  21.26 
 
 		 1150 aa  64.3  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  24.79 
 
 		 1152 aa  62.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  23.31 
 
 		 1204 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  21.09 
 
 		 1153 aa  62  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1153 aa  61.6  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  23 
 
 		 1348 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1147 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1167 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1167 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1167 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1167 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1104 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  25.68 
 
 		 1164 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  21.05 
 
 		 973 aa  58.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  20.33 
 
 		 1205 aa  58.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  28.99 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  21.05 
 
 		 973 aa  57.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  25.67 
 
 		 1176 aa  57  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1164 aa  57  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  23.27 
 
 		 1164 aa  57  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  20.59 
 
 		 1187 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1175 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  23.16 
 
 		 1329 aa  56.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  20.84 
 
 		 1194 aa  55.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1175 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  21.97 
 
 		 1157 aa  53.5  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  23 
 
 		 1289 aa  53.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1208 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  20.72 
 
 		 1182 aa  52  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  21.53 
 
 		 1209 aa  52  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  23.63 
 
 		 1317 aa  51.6  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  23.31 
 
 		 1206 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  22.46 
 
 		 1289 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  22.87 
 
 		 1289 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  23 
 
 		 1289 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  21.84 
 
 		 1148 aa  51.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1369 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1332 aa  49.7  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  21.49 
 
 		 1365 aa  50.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>