More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1592 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  82.35 
 
 		 154 aa  257  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  81.82 
 
 		 154 aa  255  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.59 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  48.57 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.57 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  48.57 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  48.57 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  47.86 
 
 		 145 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  47.86 
 
 		 145 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 179 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  42.15 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  41.91 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  39.84 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  36.17 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35.46 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35.46 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  40 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  36.3 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  27.13 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  28.57 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  31.96 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.36 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  24.81 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>