More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0498 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  853    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  85.22 
 
 		 405 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  89.25 
 
 		 400 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  63.78 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  60.53 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  51.06 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 382 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  51.06 
 
 		 381 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  50.27 
 
 		 431 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 406 aa  348  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 414 aa  345  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 465 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 		 739 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 515 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 1093 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 1093 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 618 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 3706 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 941 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 1676 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.13 
 
 		 744 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 2693 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 771 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 767 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.47 
 
 		 783 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 215 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 1654 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 1714 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1051 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 912 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 732 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 872 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 945 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 764 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 681 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 839 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  35.12 
 
 		 650 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 980 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 913 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.78 
 
 		 1239 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 746 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 729 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 834 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 771 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 878 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 347 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 1177 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 790 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 1051 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  34.33 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 1047 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 709 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  29.74 
 
 		 918 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 348 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  32.35 
 
 		 1248 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 613 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 871 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1253 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1182 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.77 
 
 		 676 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32 
 
 		 754 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 909 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 1227 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.65 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 815 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 856 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 354 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 875 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 1390 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 864 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 874 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 501 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 945 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  32.07 
 
 		 982 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  30.14 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>