More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3810 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  57.62 
 
 		 718 aa  765    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  48.43 
 
 		 727 aa  672    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  55.29 
 
 		 738 aa  791    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  57.62 
 
 		 718 aa  765    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  55.57 
 
 		 767 aa  801    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  58.19 
 
 		 721 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  81.13 
 
 		 719 aa  1083    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  57.34 
 
 		 718 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 711 aa  1409    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  57.47 
 
 		 718 aa  765    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  78.03 
 
 		 716 aa  1050    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  51.34 
 
 		 726 aa  673    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  45.51 
 
 		 740 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  46.75 
 
 		 731 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  46.75 
 
 		 733 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  40.94 
 
 		 762 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  45.3 
 
 		 731 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  40.65 
 
 		 718 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  39.89 
 
 		 712 aa  571  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  43.87 
 
 		 756 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  43.58 
 
 		 776 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  42.47 
 
 		 734 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  39.2 
 
 		 712 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  44.67 
 
 		 725 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  44.19 
 
 		 920 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  42.96 
 
 		 722 aa  559  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  40.4 
 
 		 704 aa  555  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  38.72 
 
 		 718 aa  554  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  39.07 
 
 		 734 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  41.11 
 
 		 704 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  45.08 
 
 		 719 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.12 
 
 		 711 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  41.96 
 
 		 723 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  43.55 
 
 		 721 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  44.9 
 
 		 721 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  38.83 
 
 		 738 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  41.19 
 
 		 707 aa  537  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  41.26 
 
 		 743 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  40.75 
 
 		 718 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  40.6 
 
 		 718 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  38.39 
 
 		 726 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  38.94 
 
 		 723 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  39.57 
 
 		 720 aa  528  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 		 726 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  38.83 
 
 		 725 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  38.83 
 
 		 725 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  38.97 
 
 		 726 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  38.83 
 
 		 725 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  38.68 
 
 		 725 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 		 726 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  37.8 
 
 		 725 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  38.83 
 
 		 725 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  40.26 
 
 		 737 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  38.71 
 
 		 725 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  38.56 
 
 		 725 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  41.08 
 
 		 718 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  37.43 
 
 		 725 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  39.28 
 
 		 725 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  39.91 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  42.42 
 
 		 776 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  37.86 
 
 		 727 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.43 
 
 		 694 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  37.54 
 
 		 687 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  38.48 
 
 		 719 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  37.13 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  40.42 
 
 		 779 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  37.72 
 
 		 739 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.15 
 
 		 713 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.69 
 
 		 723 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  36.99 
 
 		 712 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  36.99 
 
 		 712 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  39.05 
 
 		 706 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  35.85 
 
 		 722 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  34.29 
 
 		 720 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  36.7 
 
 		 730 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  34.99 
 
 		 733 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  35.52 
 
 		 742 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 739 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  35.99 
 
 		 765 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  34.46 
 
 		 871 aa  369  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  35.51 
 
 		 729 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  34.87 
 
 		 730 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  33.43 
 
 		 726 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  33.28 
 
 		 726 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  33.43 
 
 		 726 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  36.57 
 
 		 722 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  33.28 
 
 		 726 aa  360  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  36.27 
 
 		 722 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  36.42 
 
 		 722 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  36.27 
 
 		 722 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  34.63 
 
 		 867 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  31.58 
 
 		 701 aa  347  5e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  32.02 
 
 		 714 aa  340  8e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  32.19 
 
 		 739 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  32.45 
 
 		 728 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.79 
 
 		 741 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.61 
 
 		 722 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  33.22 
 
 		 751 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.09 
 
 		 720 aa  327  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.76 
 
 		 705 aa  326  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>