216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3298 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 293 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  64.73 
 
 		 301 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  64.03 
 
 		 305 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  59.45 
 
 		 296 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  56.63 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  49.82 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  51.27 
 
 		 318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  55.93 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  50.37 
 
 		 320 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  48.91 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  48.91 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  49.21 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  49.15 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  49.15 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  53.04 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  53.04 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  53.25 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  48.91 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  53.7 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  36.19 
 
 		 413 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  40.74 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  34.75 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.39 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.67 
 
 		 376 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.4 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  25.1 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  25.26 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  25.26 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  34.19 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  31.52 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.15 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  34.29 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  26.13 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.52 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.91 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.73 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  25.93 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.69 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  25.93 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  25.93 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  26.09 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.59 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  28.23 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.06 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  27.43 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.38 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  29.81 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  31.29 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  32.08 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  35.03 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.75 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30.82 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  28.67 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  33.57 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  32.17 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  28.03 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.49 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  32.32 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  31.87 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  28.65 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  28.8 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  31.14 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  33.54 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  34.48 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.07 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  27.57 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  27.6 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  27.38 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  26.22 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  27.59 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  31.82 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.03 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  27.03 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  31.37 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.03 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.03 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  27.37 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.23 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  32.32 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  30.08 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  28.12 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  30.08 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  27.54 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  25.69 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  28.91 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  28.91 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  29.07 
 
 		 374 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  30.15 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  25.38 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  32.68 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  27.42 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>