More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1497 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  65.16 
 
 		 555 aa  746    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  67.64 
 
 		 549 aa  740    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  66.61 
 
 		 551 aa  736    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 556 aa  1113    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  64.9 
 
 		 551 aa  737    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  51.19 
 
 		 547 aa  518  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  48.9 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  47.26 
 
 		 567 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  39.16 
 
 		 556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  46.69 
 
 		 575 aa  326  9e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  36.82 
 
 		 528 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  34.77 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 		 525 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  34.36 
 
 		 535 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  33.99 
 
 		 526 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  33.72 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  34.12 
 
 		 544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.22 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.66 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  42.19 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 		 438 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  40.17 
 
 		 450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  30.61 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.61 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 410 aa  226  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 		 452 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  40.81 
 
 		 482 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  40.81 
 
 		 482 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.71 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 		 379 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  38.04 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.34 
 
 		 457 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 		 438 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  41.35 
 
 		 445 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  40.19 
 
 		 439 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.31 
 
 		 445 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 468 aa  219  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 		 455 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 428 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  41.12 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  41.21 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  39.89 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.43 
 
 		 428 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 		 507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  38.84 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.57 
 
 		 441 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.49 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 		 544 aa  214  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 437 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.31 
 
 		 426 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.29 
 
 		 446 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  39.25 
 
 		 439 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  36.1 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 		 458 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 444 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  40.19 
 
 		 484 aa  210  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 439 aa  210  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 398 aa  210  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  39.38 
 
 		 439 aa  210  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  39.08 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  39.08 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  40.85 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  40.13 
 
 		 423 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  37.97 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  40.98 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  35.83 
 
 		 435 aa  208  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  38.89 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  40.78 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  38.39 
 
 		 456 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  34.38 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 436 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 444 aa  206  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  38.08 
 
 		 456 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  41.99 
 
 		 427 aa  203  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.87 
 
 		 458 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 480 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  39.67 
 
 		 451 aa  203  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.54 
 
 		 451 aa  203  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 		 498 aa  203  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>