185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1410 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  100 
 
 		 231 aa  483  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  66.22 
 
 		 236 aa  322  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  65.92 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  65.47 
 
 		 257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  58.74 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  55.86 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  55.41 
 
 		 229 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  50.9 
 
 		 231 aa  234  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  50.22 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  50.67 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  48.87 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  50.88 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  49.32 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  46.61 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  47.51 
 
 		 242 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  46.15 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  47.51 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  48.65 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  49.77 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  49.54 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  49.54 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  46.64 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  49.54 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  47.51 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  48.9 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  49.34 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  47.75 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  46.22 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  47.06 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  44.7 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  42.92 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  41.78 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  42.48 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  41.07 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  39.11 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  39.38 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  38.18 
 
 		 229 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  37.44 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  37.93 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  37.95 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  37.89 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  39.56 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  37.27 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  36.96 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  34.8 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  38.24 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  38.24 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  37.95 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  37.75 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  36.77 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  35.87 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.88 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  32.88 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  34.38 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  35.48 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  32.14 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  35.14 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  31.7 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  35.14 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  34.56 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  35.14 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  31.39 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  30.8 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  34.39 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  32.88 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  31.08 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.67 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  30.88 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  29.02 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.07 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.22 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  28.96 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  29.41 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  27.78 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  26.75 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  28.12 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  29.03 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  28.14 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  25.78 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  25.76 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  24.89 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  24.57 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  24.89 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  23.14 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  25.78 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  20.87 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  41.33 
 
 		 177 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  40.32 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  43.4 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  26.55 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  45.61 
 
 		 173 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  40 
 
 		 170 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  25.11 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.11 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  26.11 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.67 
 
 		 334 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.09 
 
 		 345 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>