More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1328 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  91.76 
 
 		 267 aa  519  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  91.01 
 
 		 267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  89.51 
 
 		 277 aa  511  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  54.24 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  38.49 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  36.88 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  30.56 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  29.62 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  32 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  31.98 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  30.92 
 
 		 283 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  29.39 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  27.09 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  24.54 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  27.55 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  25.69 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  26.14 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  26.54 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  27 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  40.79 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  27.38 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  26.54 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25.38 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  37.97 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  25.09 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  24.35 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  25.77 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  24.42 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  23.99 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0714  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  25.45 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  26.94 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  26.35 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  24.14 
 
 		 535 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  24.72 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  25.95 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  23.42 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  23.4 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  23.69 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  36.09 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  36.45 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  23.68 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  27.06 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  27.06 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  34.56 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  42.67 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  37.86 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  31.18 
 
 		 492 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  24.02 
 
 		 519 aa  62  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.36 
 
 		 528 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  25.77 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  30.63 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  35.53 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  23.94 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  25.98 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  23.14 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  23.14 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  35.37 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  40.54 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  26.59 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  30.66 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  27.34 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  23.92 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1922  DNA repair protein RadA  33.33 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000667281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  31.39 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  34.62 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  34.62 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  26.27 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  33.54 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  33.33 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  23.37 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  38.83 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  31.73 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  22.75 
 
 		 498 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  36.47 
 
 		 464 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  34.52 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  22.79 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  40.85 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  26.1 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  35.24 
 
 		 456 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  24.71 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  23.92 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0415  DNA repair protein RadA  36.54 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  42.31 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  39.47 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  25.51 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  24.62 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  32.67 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  33.98 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  32.84 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.34 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  34.62 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  38.27 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  33.65 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>