More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1922 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  80.88 
 
 		 460 aa  771    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  80.88 
 
 		 460 aa  772    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  68.19 
 
 		 458 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 454 aa  686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3589  DNA repair protein RadA  77.01 
 
 		 461 aa  708    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  80.88 
 
 		 460 aa  771    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 454 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1226  DNA repair protein RadA  72.37 
 
 		 454 aa  687    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 454 aa  686    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  80.88 
 
 		 460 aa  771    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  79.78 
 
 		 460 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  79.78 
 
 		 460 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0449  DNA repair protein RadA  77.01 
 
 		 460 aa  720    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0204936  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  79.78 
 
 		 460 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  93.03 
 
 		 459 aa  882    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  70.83 
 
 		 455 aa  686    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0981  DNA repair protein RadA  73.63 
 
 		 454 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.188403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  80.88 
 
 		 460 aa  771    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3219  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 454 aa  686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3492  DNA repair protein RadA  78.02 
 
 		 460 aa  747    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  92.81 
 
 		 459 aa  884    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0546  DNA repair protein RadA  77.01 
 
 		 460 aa  721    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2814  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 		 454 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  80.88 
 
 		 460 aa  771    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  87.58 
 
 		 459 aa  845    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3470  DNA repair protein RadA  78.31 
 
 		 461 aa  728    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  70.99 
 
 		 454 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3621  DNA repair protein RadA  78.02 
 
 		 460 aa  747    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1035  DNA repair protein RadA  72.31 
 
 		 458 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  78.95 
 
 		 461 aa  752    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  80.88 
 
 		 460 aa  771    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  78.02 
 
 		 460 aa  747    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  70.42 
 
 		 454 aa  667    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  79.56 
 
 		 460 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  77.61 
 
 		 461 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  75.6 
 
 		 458 aa  721    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  72.37 
 
 		 454 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  72.37 
 
 		 454 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  80.88 
 
 		 460 aa  771    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  79.78 
 
 		 460 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1922  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 459 aa  939    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000667281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  72.37 
 
 		 454 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  80.88 
 
 		 460 aa  771    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3659  DNA repair protein RadA  68.4 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.217436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  65.58 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  62.56 
 
 		 457 aa  597  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  61.05 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  61.05 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  60.61 
 
 		 455 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  59.78 
 
 		 455 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  59.78 
 
 		 455 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  60.39 
 
 		 477 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  59.74 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  60.57 
 
 		 453 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  60.7 
 
 		 453 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  59.74 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  59.74 
 
 		 456 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  58.28 
 
 		 451 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  58.28 
 
 		 451 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  59.69 
 
 		 457 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  58.87 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  58.86 
 
 		 458 aa  541  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  58.9 
 
 		 448 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  57.43 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  57.65 
 
 		 450 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4095  DNA repair protein RadA  56.61 
 
 		 452 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4000  DNA repair protein RadA  56.83 
 
 		 452 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  58.35 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  56.67 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  57.46 
 
 		 451 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  56.17 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  56.17 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  54.05 
 
 		 482 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  56.39 
 
 		 460 aa  511  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  54.24 
 
 		 481 aa  510  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  55.02 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  56.67 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  56.67 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  55.31 
 
 		 453 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  56.67 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  55.8 
 
 		 458 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  56.02 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  55.36 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  55.44 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  56.46 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  55.8 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  55.8 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  55.75 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  55.75 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  55.14 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  55.31 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>