More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2683 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  40.62 
 
 		 953 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  39.01 
 
 		 952 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.51 
 
 		 974 aa  738    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  40.62 
 
 		 953 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  54.36 
 
 		 946 aa  1005    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1149 aa  2358    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  37.53 
 
 		 949 aa  622  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  37.47 
 
 		 949 aa  620  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  36.44 
 
 		 980 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  34.15 
 
 		 1053 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  33.41 
 
 		 993 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  37.17 
 
 		 938 aa  350  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  36.48 
 
 		 848 aa  346  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  34.87 
 
 		 812 aa  344  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  33.63 
 
 		 815 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  34.64 
 
 		 813 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.78 
 
 		 979 aa  339  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  33.68 
 
 		 1287 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  34.9 
 
 		 1077 aa  323  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  28.73 
 
 		 979 aa  317  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  27.54 
 
 		 928 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  34.88 
 
 		 967 aa  314  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  32.62 
 
 		 1028 aa  314  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  31.81 
 
 		 1042 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  32.65 
 
 		 987 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  33.45 
 
 		 956 aa  310  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  27.22 
 
 		 1033 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  31.62 
 
 		 1033 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  26.98 
 
 		 1041 aa  308  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  33.11 
 
 		 1062 aa  308  5.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  30.43 
 
 		 1418 aa  307  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  31.43 
 
 		 1033 aa  299  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  29.98 
 
 		 1051 aa  295  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  30.62 
 
 		 1063 aa  295  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  28.73 
 
 		 1043 aa  293  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  29.98 
 
 		 1066 aa  292  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  25.08 
 
 		 1058 aa  291  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  30.96 
 
 		 1065 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  32.38 
 
 		 1348 aa  288  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  27.98 
 
 		 1061 aa  280  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  34.4 
 
 		 1055 aa  280  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  28.13 
 
 		 1017 aa  279  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  34.4 
 
 		 1055 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  34.59 
 
 		 1055 aa  280  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  29.58 
 
 		 1042 aa  277  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  33.83 
 
 		 982 aa  277  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.39 
 
 		 1031 aa  277  8e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  28.91 
 
 		 1035 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  27.23 
 
 		 1052 aa  274  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  27.5 
 
 		 1051 aa  272  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  29.93 
 
 		 1029 aa  269  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  32.01 
 
 		 905 aa  265  3e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  33.75 
 
 		 967 aa  259  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  34.76 
 
 		 773 aa  178  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 		 475 aa  153  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  27.48 
 
 		 536 aa  139  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  43.15 
 
 		 800 aa  138  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  43.84 
 
 		 793 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 		 524 aa  134  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  29.08 
 
 		 606 aa  132  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  26.95 
 
 		 459 aa  131  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.68 
 
 		 629 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 607 aa  125  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.49 
 
 		 560 aa  125  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  44.3 
 
 		 796 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  40.27 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  26.1 
 
 		 469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  24.12 
 
 		 462 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 560 aa  114  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  24.19 
 
 		 583 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  24.15 
 
 		 643 aa  112  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 560 aa  111  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  24.82 
 
 		 899 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 560 aa  110  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 398 aa  110  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  25.88 
 
 		 797 aa  109  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.03 
 
 		 385 aa  109  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  25.7 
 
 		 771 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  25.94 
 
 		 560 aa  108  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  25.5 
 
 		 875 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  25.94 
 
 		 560 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.7 
 
 		 804 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  24.52 
 
 		 760 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  29.26 
 
 		 860 aa  105  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  24.1 
 
 		 899 aa  104  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 760 aa  104  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  24.81 
 
 		 802 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  24.6 
 
 		 796 aa  104  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.58 
 
 		 706 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  26.76 
 
 		 574 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  25.62 
 
 		 776 aa  103  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  25.2 
 
 		 783 aa  102  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  25.26 
 
 		 1138 aa  101  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  27.2 
 
 		 585 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  26.47 
 
 		 811 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  27.58 
 
 		 558 aa  100  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  25.13 
 
 		 1126 aa  99.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 581 aa  99.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  27.47 
 
 		 787 aa  97.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1131 aa  97.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>