22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1077 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 796 aa  1664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  58.52 
 
 		 793 aa  989    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  55.16 
 
 		 800 aa  893    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  54.63 
 
 		 622 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  50.49 
 
 		 816 aa  818    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  39.27 
 
 		 629 aa  452  1e-125  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  32 
 
 		 635 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  31.03 
 
 		 634 aa  279  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  32.11 
 
 		 624 aa  276  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  25.68 
 
 		 416 aa  130  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  26.76 
 
 		 650 aa  128  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  44.3 
 
 		 1149 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  24.34 
 
 		 401 aa  122  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1364  putative phage repressor  44.22 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0666376  normal  0.101341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  23.82 
 
 		 600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  26.74 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  25.59 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  25.52 
 
 		 389 aa  97.8  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  22.54 
 
 		 719 aa  68.9  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0593  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 		 225 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2943  hypothetical protein  25.31 
 
 		 659 aa  44.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1039  primosomal protein N'  27.89 
 
 		 519 aa  44.3  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0857147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>