16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1525 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  837    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  51.51 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  44.27 
 
 
403 aa  349  5e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  42.39 
 
 
416 aa  340  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  35.71 
 
 
389 aa  270  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  29.92 
 
 
719 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  26.08 
 
 
650 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  26.02 
 
 
800 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  26.72 
 
 
793 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  25.67 
 
 
622 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  25.59 
 
 
796 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  22.73 
 
 
635 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  25.37 
 
 
624 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  23.36 
 
 
634 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  25.76 
 
 
629 aa  93.6  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  23.86 
 
 
816 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>