21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1299 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  50.49 
 
 		 796 aa  818    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  50.24 
 
 		 793 aa  834    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  49.82 
 
 		 800 aa  789    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  100 
 
 		 816 aa  1690    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  48.97 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  38.93 
 
 		 629 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  31.29 
 
 		 635 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  30.08 
 
 		 624 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  28.12 
 
 		 634 aa  232  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  40.27 
 
 		 1149 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  28.12 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  24.18 
 
 		 401 aa  97.8  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1364  putative phage repressor  37.24 
 
 		 190 aa  95.1  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0666376  normal  0.101341 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  23.86 
 
 		 407 aa  89.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  22.19 
 
 		 600 aa  86.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  23.53 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  23.82 
 
 		 389 aa  76.6  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  23.85 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  23.84 
 
 		 719 aa  73.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  28.46 
 
 		 281 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  28.46 
 
 		 281 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>