19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1634 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  100 
 
 
634 aa  1299    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  52.52 
 
 
624 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  34.64 
 
 
635 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  31.03 
 
 
796 aa  279  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  32.39 
 
 
622 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  32.47 
 
 
793 aa  269  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  31.23 
 
 
800 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  26.83 
 
 
629 aa  265  2e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  28.12 
 
 
816 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  27.68 
 
 
600 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  26.4 
 
 
650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  23.7 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  23.36 
 
 
407 aa  95.1  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  24.19 
 
 
416 aa  88.2  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  22.94 
 
 
403 aa  87.4  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  22.72 
 
 
719 aa  79.3  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  22.28 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0802  hypothetical protein  22.63 
 
 
662 aa  51.2  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000629904  normal  0.50337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  32.29 
 
 
450 aa  47.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>