21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1124 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  55.31 
 
 
800 aa  912    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  58.52 
 
 
796 aa  989    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  100 
 
 
793 aa  1641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  53.37 
 
 
622 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  50.24 
 
 
816 aa  834    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  38.13 
 
 
629 aa  459  1e-127  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  33.59 
 
 
635 aa  333  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  33.44 
 
 
624 aa  279  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  32.47 
 
 
634 aa  269  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  43.84 
 
 
1149 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  26.89 
 
 
650 aa  127  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1364  putative phage repressor  43.24 
 
 
190 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0666376  normal  0.101341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  24.26 
 
 
600 aa  108  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  26.72 
 
 
407 aa  108  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  27.39 
 
 
389 aa  106  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  23.43 
 
 
401 aa  105  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  22.61 
 
 
416 aa  96.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  23.51 
 
 
403 aa  94  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  26.05 
 
 
719 aa  87.4  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0593  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 
225 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0004  hypothetical protein  21.71 
 
 
660 aa  48.9  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0778574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>