22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1358 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  55.16 
 
 		 796 aa  893    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  55.31 
 
 		 793 aa  912    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  58.67 
 
 		 622 aa  749    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  49.82 
 
 		 816 aa  789    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  38.23 
 
 		 629 aa  432  1e-119  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  33.18 
 
 		 635 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  30.52 
 
 		 624 aa  276  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  31.23 
 
 		 634 aa  267  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  43.15 
 
 		 1149 aa  138  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1364  putative phage repressor  43.41 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0666376  normal  0.101341 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  25.37 
 
 		 401 aa  128  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  27.25 
 
 		 650 aa  118  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  26.02 
 
 		 407 aa  117  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  22.5 
 
 		 600 aa  99.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  24.39 
 
 		 416 aa  94.4  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  26.76 
 
 		 403 aa  94.4  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  24.17 
 
 		 389 aa  91.7  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  22.73 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0593  transcriptional regulator, XRE family  27.7 
 
 		 225 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0351  hypothetical protein  22.25 
 
 		 634 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000201568  normal  0.805939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0802  hypothetical protein  32.23 
 
 		 662 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000629904  normal  0.50337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>