17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0552 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  100 
 
 
719 aa  1497    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  29.92 
 
 
407 aa  175  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  28.24 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  29 
 
 
416 aa  163  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  28.57 
 
 
403 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  26.47 
 
 
650 aa  152  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  26.81 
 
 
389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  26.05 
 
 
793 aa  87.4  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  22.73 
 
 
800 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  21.7 
 
 
624 aa  80.9  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  22.72 
 
 
634 aa  79.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  23.84 
 
 
816 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  23.42 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  22.54 
 
 
796 aa  68.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  25 
 
 
635 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  20.99 
 
 
629 aa  57  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  24 
 
 
600 aa  49.7  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>