17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0957 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  74.01 
 
 
403 aa  635    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  867    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  45.23 
 
 
401 aa  361  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  42.39 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  37.18 
 
 
389 aa  272  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  29 
 
 
719 aa  163  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  27.29 
 
 
650 aa  136  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  25.68 
 
 
796 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  26.59 
 
 
622 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  25.83 
 
 
635 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  22.61 
 
 
793 aa  96.7  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  24.94 
 
 
624 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  24.39 
 
 
800 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  24.19 
 
 
634 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  23.53 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  22.36 
 
 
629 aa  75.9  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  28.95 
 
 
600 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>