18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0678 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  58.67 
 
 		 800 aa  761    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  54.63 
 
 		 796 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  53.37 
 
 		 793 aa  707    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  100 
 
 		 622 aa  1287    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  48.97 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  40.16 
 
 		 629 aa  463  1e-129  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  33.28 
 
 		 635 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  32.39 
 
 		 634 aa  280  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  30.9 
 
 		 624 aa  277  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 650 aa  134  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  26.59 
 
 		 416 aa  125  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  25.62 
 
 		 600 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  25.48 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  24.25 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  26.11 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  27.43 
 
 		 389 aa  107  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  23.36 
 
 		 719 aa  74.7  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 728 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>