17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0964 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1211    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  27.68 
 
 		 634 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  23.82 
 
 		 796 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  25 
 
 		 622 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  24.61 
 
 		 635 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  25.12 
 
 		 624 aa  114  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  22.03 
 
 		 629 aa  109  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  24.26 
 
 		 793 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  22.5 
 
 		 800 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  22.19 
 
 		 816 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  23.02 
 
 		 401 aa  62  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  24 
 
 		 719 aa  49.7  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  24.08 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.41 
 
 		 790 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.42 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  38.57 
 
 		 943 aa  43.9  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  28.95 
 
 		 416 aa  43.5  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>