17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1526 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  831    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  51.51 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  47.1 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  45.23 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  37.15 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  28.24 
 
 		 719 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  25.37 
 
 		 800 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  24.34 
 
 		 796 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  26.18 
 
 		 624 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  23.71 
 
 		 650 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  25.24 
 
 		 629 aa  110  6e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  24.18 
 
 		 622 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  25.62 
 
 		 635 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  23.43 
 
 		 793 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  24.18 
 
 		 816 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  23.7 
 
 		 634 aa  96.3  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  23.02 
 
 		 600 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>