16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1900 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  100 
 
 		 389 aa  810    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  37.15 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  36.32 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  37.18 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  35.71 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  26.81 
 
 		 719 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  27.43 
 
 		 622 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  27.39 
 
 		 793 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  24.74 
 
 		 635 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  24.39 
 
 		 650 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  25.52 
 
 		 796 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  24.17 
 
 		 800 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  23.12 
 
 		 624 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  22.76 
 
 		 629 aa  80.1  0.00000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  23.82 
 
 		 816 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  22.28 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>