17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1350 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  828    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  74.01 
 
 		 416 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  47.1 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  44.27 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  36.32 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 719 aa  159  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  28.64 
 
 		 650 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  26.74 
 
 		 796 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  25.41 
 
 		 622 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  26.03 
 
 		 629 aa  95.9  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  26.76 
 
 		 800 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  23.51 
 
 		 793 aa  94  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  24.45 
 
 		 635 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  22.2 
 
 		 624 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  22.94 
 
 		 634 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  23.85 
 
 		 816 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  29.06 
 
 		 600 aa  43.5  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>