18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0929 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0929  ATP/GTP-binding protein, putative  100 
 
 
635 aa  1315    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000692715  unclonable  0.00000000000771269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1634  AAA ATPase  34.64 
 
 
634 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0557506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1077  hypothetical protein  32 
 
 
796 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0678  ATP/GTP-binding protein, putative  33.28 
 
 
622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.0000355403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2554  Protein of unknown function DUF2075  33.33 
 
 
624 aa  337  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0156913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  33.59 
 
 
793 aa  333  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1358  hypothetical protein  33.18 
 
 
800 aa  333  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.908029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1299  AAA ATPase  31.29 
 
 
816 aa  306  7e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl298  ATP/GTP binding protein  28.77 
 
 
629 aa  283  9e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.15343e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0964  hypothetical protein  24.61 
 
 
600 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.624537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0957  hypothetical protein  25.83 
 
 
416 aa  109  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.62553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1526  hypothetical protein  25.62 
 
 
401 aa  107  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1900  thymidine kinase  24.74 
 
 
389 aa  101  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.251857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1525  hypothetical protein  22.73 
 
 
407 aa  99.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1350  hypothetical protein  24.45 
 
 
403 aa  94  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000671971  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19650  hypothetical protein  23.2 
 
 
650 aa  93.6  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0552  hypothetical protein  25 
 
 
719 aa  62  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0351  hypothetical protein  20.9 
 
 
634 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000201568  normal  0.805939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>